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提前30天預報海洋環(huán)境數(shù)據(jù)
海洋國家實驗室“超級計算機”初顯威力
青島日報/青島觀/青報網(wǎng)訊 記者日前從青島海洋科學與技術國家實驗室獲悉，自2016年12月投入應用一年來，我國海洋科研領域運算速度最快的高性能科學計算與系統(tǒng)仿真平臺——P級“超級計算機”，在海洋環(huán)境預報和海洋藥物篩選領域發(fā)揮了重要作用：海洋預報分辨率達到10公里級，預報時效可延伸至30天；初步完成了170個抗腫瘤藥物靶點與1800萬生物小分子的篩選，并實現(xiàn)每兩天完成一個靶點與1800萬生物小分子的對接。
借助“超級計算機”的超強計算能力，海洋國家實驗室在全球率先實現(xiàn)了對西太平洋、印度洋和中國南�！皟裳笠缓！眳^(qū)域的海洋氣象環(huán)境預報，預報時間從常規(guī)一周內(nèi)，擴展到可預警30天內(nèi)的災害性海洋狀況，預報的分辨率也從以往的35公里精進到10公里以內(nèi)，比國際上先進的海洋預報還要精確數(shù)十倍之多。
更精細、更準確、更長期的海洋預報是海洋生命線的可靠保障，未來隨著每秒運算速度達百億億次的E級超算落戶青島，將使該預報系統(tǒng)的分辨能力再提升10倍，突破500米大關，海洋學家們可以捕捉預測更精準細微的海洋現(xiàn)象。
據(jù)海洋國家實驗室超算平臺主任魏志強介紹，除了海洋預報，P級超算已成功應用于海洋藥物篩選。魏志強告訴記者，人類19000個基因可以編碼出20萬個蛋白質(zhì)，其中可以與藥物結合的“靶點蛋白”有893個。截至去年年底，超算平臺已經(jīng)初步完成了對893個藥物靶蛋白中的170個抗腫瘤靶點的虛擬篩選。
這個計算量到底有多大？“如果沒有超算平臺這幾乎是不可能完成的任務，在普通計算平臺上，要找到這170個抗腫瘤藥物靶點至少也要耗時幾十年�！蔽褐緩娬f，而海洋國家實驗室的超級計算機只用了大約半年時間。
據(jù)了解，海洋國家實驗室的遠期目標是將893個藥物靶蛋白與4000萬個可以用于制藥的生物小分子進行對接。這項工作的計算量在目前的超算平臺大約要耗時22年，如果將來E級超算建成，可以在3至4個月內(nèi)完成。
目前，海洋國家實驗室海洋創(chuàng)新藥物篩選與評價平臺、高性能科學計算與系統(tǒng)仿真平臺、青島海洋生物醫(yī)藥研究院、中國海洋大學、江蘇理工大學已經(jīng)聯(lián)合提出了“智能超算藥物組學計劃”，藥物計算系統(tǒng)軟件已在超算平臺平穩(wěn)運行，能夠?qū)崿F(xiàn)兩天內(nèi)對1800萬分子的篩選。同時，項目組還建立了含有近萬個分子的海洋化合物庫。
(記者 王娉）
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